با تشکر از شما دوست عزیز! خواستم فایل نمونه‌ی کوچکی بسازم بعد از ساختن و اجرا فرمول‌ها درست نمایش داده شدند. به نظرم رسید که مشکل باید از دستوراتی باشد که من در کارم استفاده کرده‌ام. این پروژه شامل ۱۲ فایل است که یکی‌یکی آن‌ها را از فایل اصلی خارج کردم. فایلی که مشکل‌دار بود پیدا شد. مقداری هم در طول فایل حرکت کردم. اعداد در تمام فرمول‌های ریاضی که بعد از بلاک زیر نوشته می‌شوند انگلیسی بودند:
\latin
\begin{verbatim}
some text...
\end{verbatim}
\persian
اگر در مورد دلیل‌اش راهنمایی بفرمایید ممنون می‌شوم. این صرفا برای کنجکاوی و یاد گرفتن است و مشکل حل شد. در ضمن ممنون از شما و تریگر شما :-)
تنها مطلبی که باید بگم اینه که دستورهای \Latin و \Persian دیگه منسوخ شده‌اند و به جاشون باید از محیط
\begin{latin}
متن لاتین خود را اینجا بنویسید.
\end{latin}
استفاده کنید.
قبلش هم زی‌پرشین و بی‌دی و ... خود را آپدیت کنید.