\documentclass[oneside,openany,phd]{report}
\usepackage{amsthm,amssymb,amsmath}



\usepackage{xepersian}
\settextfont[Scale=1.1]{XB Niloofar}
\makeatletter
\def\@myabjad#1{\ifcase#1\or الفـ\or ب\or ج\or د\or ه\or و \or ز\or ح\or ط\or ی\or ک\or ل\or م\or ن\or س\or ع\or ف\or ص\or غ\or  ر \or ش\or ت\or ث\
else\@ctrerr\fi}
\makeatother


\begin{document}
\pagenumbering{myabjad}
این فایل نمونه است.
\newpage
چکیده:
\newpage
سپاسگزاری:
\newpage
در این قسمت تصمیم دارم که هنوز شماره گذاری با حروف ابجد ادامه داشته باشد اما فهرست مطالبم از صغحه ۱ شماره‌گذاری می‌شود.
\tableofcontents
\pagenumbering{arabic}

 \chapter{مقدمات و پیشنیازها}
 این فصل شامل مقدمات است.



\end{document}