\documentclass{article}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{amssymb}
\usepackage{amsthm}
\usepackage{xepersian}
\begin{document}
یک فرمول در محیط معادله:
\[\vDash^{{\mathcal{M}}_i}A\rightarrow B\]

و یک فرمول درون متن فارسی است. 
\mbox{$\vDash^{{\mathcal{M}}_i}A\rightarrow B$}


سایز قلم در دو حالت بر خلاف محیط لاتین بدون تفاوت است!
\end{document}