\documentclass{article}
\usepackage{amsthm,amsmath} 
\usepackage{xepersian}
\settextfont{XB Zar}
\theoremstyle{plain}
\newtheorem{theorem}{قضیه}

\begin{document}

\begin{theorem}[\cite[صفحه ۱۲]{Pourmousa88mscThesis}]
این یک قضیه است.
\end{theorem}
\bibliographystyle{plain-fa}
\bibliography{MyReferences}

\end{document}