\documentclass{report}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{Yas}
\setdigitfont{Yas}
\begin{document}
\begin{thebibliography}{99}
\bibitem{2}
مرجع فارسی
\begin{LTRbibitems}
\resetlatinfont
\bibitem{1}
Latin Reference
\end{LTRbibitems}
\end{thebibliography}
\end{document}