بنابر مشکل زیر:
https://github.com/persian-tex/bidi/issues/4
هر گاه نوشته‌ای دوستونه باشد، بسته bidi بصورت خودکار بسته ftnright را فراخوانی می‌کند. تغییرات بسته ftnright در ماکروی \@outputdblcol در تغییرات بسته‌های fix2col و cuted نیز انجام شده تا تنظیمات هیچ یک از بسته‌ها از بین نرود. همچنین دیگر نیازی به تغییر بسته bidi در ماکروی \@oupitdblcol در لاتک نبود که این تغییرات حذف شده‌اند. پشینهاد می‌کنم کمی آژمایش کنید و اگر مشکلی بود در github گزارش کنید.